(file) Return to sharp.c CVS log (file) (dir) Up to [Development] / JSOC / proj / sharp / apps

Diff for /JSOC/proj/sharp/apps/sharp.c between version 1.16 and 1.20

version 1.16, 2013/07/04 02:14:14 version 1.20, 2014/02/13 04:41:06
Line 22 
Line 22 
  *              v0.2    Sep 04 2012  *              v0.2    Sep 04 2012
  *              v0.3    Dec 18 2012  *              v0.3    Dec 18 2012
  *              v0.4    Jan 02 2013  *              v0.4    Jan 02 2013
  *      v0.5    Jan 23 2012   *      v0.5    Jan 23 2013
    *              v0.6    Aug 12 2013
    *      v0.7    Jan 02 2014
    *              v0.8    Feb 12 2014
  *  *
  *      Notes:  *      Notes:
  *              v0.0  *              v0.0
Line 42 
Line 45 
  *              Took out convert_inplace(). Was causing all the images to be int  *              Took out convert_inplace(). Was causing all the images to be int
  *      v0.5  *      v0.5
  *      Corrected ephemeris keywords, added argument mInfo for setKeys()  *      Corrected ephemeris keywords, added argument mInfo for setKeys()
    *              v0.6
    *              Changes in remapping of bitmap and conf_disambig, now near neighbor without anti-aliasing
    *      v0.7
    *      Added full disk as "b"
    *      Global flag fullDisk is set if "b" is set
    *      Utilize BharpRS and BharpRec all around
    *      Pass mharpRec to set_keys() too in case of full disk
    *      Fixed Bunit (removed from copy_me_keys(), added loops for Bunits in set_keys() here)
    *      Error for CEA still does account for disambiguation yet
    *              v0.8
    *              Added disambig to azimuth during error propagation
    *              Changed usage for disambig: bit 2 (radial acute) for full disk, bit 0 for patch
    *              Fixed disambig cutout for patch: 0 for even, 7 for odd
    *
  *  *
  *      Example:  *      Example:
  *      sharp "mharp=hmi.Mharp_720s[1404][2012.02.20_10:00]" \    B (full disk disambiguation)
  "bharp=hmi_test.Bharp_720s_fd10[1404][2012.02.20_10:00]" \   sharp "mharp=hmi.Mharp_720s[1832][2012.07.12_15:24]" "b=hmi_test.B_720s[2012.07.12_15:24]" "dop=hmi.V_720s[2012.07.12_15:24]" "cont=hmi.Ic_720s[2012.07.12_15:24]" "sharp_cea=su_xudong.sharp_cea_720s" "sharp_cut=su_xudong.sharp_720s"
  "dop=hmi.V_720s[2012.02.20_10:00]" \   BHARP (patch disambiguation)
  "cont=hmi.Ic_720s[2012.02.20_10:00]" \   sharp "mharp=hmi.Mharp_720s[1832][2012.07.12_15:24]" "bharp=hmi.Bharp_720s[1832][2012.07.12_15:24]" "dop=hmi.V_720s[2012.07.12_15:24]" "cont=hmi.Ic_720s[2012.07.12_15:24]" "sharp_cea=su_xudong.sharp_cea_720s" "sharp_cut=su_xudong.sharp_720s"
  "sharp_cea=su_xudong.Sharp_CEA" "sharp_cut=su_xudong.Sharp_Cut"   *
  *      For comparison:  *      For comparison:
  *      bmap "in=hmi_test.Bharp_720s_fd10[1404][2012.02.20_10:00]" \  *      bmap "in=hmi_test.Bharp_720s_fd10[1404][2012.02.20_10:00]" \
  "out=hmi_test.B_720s_CEA" -s -a "map=cyleqa"  "out=hmi_test.B_720s_CEA" -s -a "map=cyleqa"
Line 239  int getEphemeris(DRMS_Record_t *inRec, s
Line 256  int getEphemeris(DRMS_Record_t *inRec, s
 void findCoord(struct mapInfo *mInfo); void findCoord(struct mapInfo *mInfo);
  
 /* Mapping function */ /* Mapping function */
 int performSampling(float *outData, float *inData, struct mapInfo *mInfo);  int performSampling(float *outData, float *inData, struct mapInfo *mInfo, int interpOpt);
  
 /* Performing local vector transformation */ /* Performing local vector transformation */
 void vectorTransform(float *bx_map, float *by_map, float *bz_map, struct mapInfo *mInfo); void vectorTransform(float *bx_map, float *by_map, float *bz_map, struct mapInfo *mInfo);
Line 276  void computeSWIndex(struct swIndex *swKe
Line 293  void computeSWIndex(struct swIndex *swKe
 void setSWIndex(DRMS_Record_t *outRec, struct swIndex *swKeys_ptr); void setSWIndex(DRMS_Record_t *outRec, struct swIndex *swKeys_ptr);
  
 /* Set all keywords, no error checking for now */ /* Set all keywords, no error checking for now */
 void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS_Record_t *inRec, struct mapInfo *mInfo);  // Changed Dec 30 XS
   void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS_Record_t *mharpRec, DRMS_Record_t *bharpRec, struct mapInfo *mInfo);
  
 // =================== // ===================
  
Line 316  char *CutSegs[] = {"magnetogram", "bitma
Line 334  char *CutSegs[] = {"magnetogram", "bitma
         "field_inclination_err", "field_az_err", "inclin_azimuth_err",         "field_inclination_err", "field_az_err", "inclin_azimuth_err",
         "field_alpha_err","inclination_alpha_err", "azimuth_alpha_err",         "field_alpha_err","inclination_alpha_err", "azimuth_alpha_err",
         "disambig", "conf_disambig"};         "disambig", "conf_disambig"};
 char *CEASegs[] = {"magnetogram", "bitmap", "Dopplergram", "continuum", "disambig",  char *CEASegs[] = {"magnetogram", "bitmap", "Dopplergram", "continuum",
         BR_SEG_CEA, BT_SEG_CEA, BP_SEG_CEA, BR_ERR_SEG_CEA, BT_ERR_SEG_CEA, BP_ERR_SEG_CEA};          BR_SEG_CEA, BT_SEG_CEA, BP_SEG_CEA, BR_ERR_SEG_CEA, BT_ERR_SEG_CEA, BP_ERR_SEG_CEA, "conf_disambig"};
   // For Bunits, added Dec 30 XS
   char *CutBunits[] = {"Mx/cm^2", " ", "cm/s", "DN/s",
       "degree", "degree", "Mx/cm^2", "cm/s", "mA", " ",
       "length units", "DN/s", "DN/s", " ", " ",
       " ",
       " ", " ",
       "degree", "degree", "Mx/cm^2", "cm/s", " ",
       " ", " ", " ",
       " ", " ", " ",
       " ", " "};
   char *CEABunits[] = {"Mx/cm^2", " ", "cm/s", "DN/s", " ",
       "Mx/cm^2", "Mx/cm^2", "Mx/cm^2", "Mx/cm^2", "Mx/cm^2", "Mx/cm^2"};
  
 /* ========================================================================================================== */ /* ========================================================================================================== */
  
 char *module_name = "sharp"; char *module_name = "sharp";
 char *version_id = "2013 Jun 26";  /* Version number */  
 int seed; int seed;
  
   int fullDisk;       // full disk mode
   
 ModuleArgs_t module_args[] = ModuleArgs_t module_args[] =
 { {
         {ARG_STRING, "mharp", kNotSpecified, "Input Mharp series."},         {ARG_STRING, "mharp", kNotSpecified, "Input Mharp series."},
         {ARG_STRING, "bharp", kNotSpecified, "Input Bharp series."},         {ARG_STRING, "bharp", kNotSpecified, "Input Bharp series."},
       {ARG_STRING, "b", kNotSpecified, "Input B series, if set, overrides bharp."},
         {ARG_STRING, "dop", kNotSpecified, "Input Doppler series."},         {ARG_STRING, "dop", kNotSpecified, "Input Doppler series."},
         {ARG_STRING, "cont", kNotSpecified, "Input Continuum series."},         {ARG_STRING, "cont", kNotSpecified, "Input Continuum series."},
         {ARG_STRING, "sharp_cea", kNotSpecified, "Output Sharp CEA series."},         {ARG_STRING, "sharp_cea", kNotSpecified, "Output Sharp CEA series."},
Line 345  int DoIt(void)
Line 377  int DoIt(void)
         int status = DRMS_SUCCESS;         int status = DRMS_SUCCESS;
         int nrecs, irec;         int nrecs, irec;
  
         char *mharpQuery, *bharpQuery;          char *mharpQuery, *bharpQuery, *bQuery;
         char *dopQuery, *contQuery;         char *dopQuery, *contQuery;
         char *sharpCeaQuery, *sharpCutQuery;         char *sharpCeaQuery, *sharpCutQuery;
  
Line 356  int DoIt(void)
Line 388  int DoIt(void)
  
         mharpQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "mharp");         mharpQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "mharp");
         bharpQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "bharp");         bharpQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "bharp");
       bQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "b");
         dopQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "dop");         dopQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "dop");
         contQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "cont");         contQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "cont");
         sharpCeaQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "sharp_cea");         sharpCeaQuery = (char *) params_get_str(&cmdparams, "sharp_cea");
Line 365  int DoIt(void)
Line 398  int DoIt(void)
  
         /* Get input data, check everything */         /* Get input data, check everything */
  
       // Full disk mode if "b" is set
       if (strcmp(bQuery, kNotSpecified)) {
           fullDisk = 1;
           bharpQuery = bQuery;
   //        SHOW(bharpQuery); SHOW("\n");
           SHOW("Full disk mode\n");
       } else {
           fullDisk = 0;
           SHOW("Harp mode\n");
       }
   
       // Bharp point to B if full disk
         if (getInputRS(&mharpRS, &bharpRS, mharpQuery, bharpQuery))         if (getInputRS(&mharpRS, &bharpRS, mharpQuery, bharpQuery))
                 DIE("Input harp data error.");                 DIE("Input harp data error.");
         nrecs = mharpRS->n;         nrecs = mharpRS->n;
Line 384  int DoIt(void)
Line 429  int DoIt(void)
                 /* Records in work */                 /* Records in work */
  
                 DRMS_Record_t *mharpRec = NULL, *bharpRec = NULL;                 DRMS_Record_t *mharpRec = NULL, *bharpRec = NULL;
   
                 mharpRec = mharpRS->records[irec];                 mharpRec = mharpRS->records[irec];
                 bharpRec = bharpRS->records[irec];  
  
                 TIME trec = drms_getkey_time(mharpRec, "T_REC", &status);                 TIME trec = drms_getkey_time(mharpRec, "T_REC", &status);
  
                   if (!fullDisk) {
               bharpRec = bharpRS->records[irec];
           } else {
               if (getInputRec_aux(&bharpRec, bharpRS, trec)) {     // Bharp point to full disk B
                   printf("Fetching B failed, image #%d skipped.\n", irec);
                   continue;
               }
           }
   
                 struct swIndex swKeys;                 struct swIndex swKeys;
  
                 DRMS_Record_t *dopRec = NULL, *contRec = NULL;                 DRMS_Record_t *dopRec = NULL, *contRec = NULL;
   
                 if (getInputRec_aux(&dopRec, dopRS, trec)) {                 if (getInputRec_aux(&dopRec, dopRS, trec)) {
                         printf("Fetching Doppler failed, image #%d skipped.\n", irec);                         printf("Fetching Doppler failed, image #%d skipped.\n", irec);
                         continue;                         continue;
Line 470  int getInputRS(DRMS_RecordSet_t **mharpR
Line 525  int getInputRS(DRMS_RecordSet_t **mharpR
         *mharpRS_ptr = drms_open_records(drms_env, mharpQuery, &status);         *mharpRS_ptr = drms_open_records(drms_env, mharpQuery, &status);
     if (status || (*mharpRS_ptr)->n == 0) return 1;     if (status || (*mharpRS_ptr)->n == 0) return 1;
  
           if (fullDisk) {
           if (getInputRS_aux(bharpRS_ptr, bharpQuery, *mharpRS_ptr)) return 1;
       } else {
         *bharpRS_ptr = drms_open_records(drms_env, bharpQuery, &status);         *bharpRS_ptr = drms_open_records(drms_env, bharpQuery, &status);
     if (status || (*bharpRS_ptr)->n == 0) return 1;     if (status || (*bharpRS_ptr)->n == 0) return 1;
   
         if (compareHarp((*mharpRS_ptr), (*bharpRS_ptr))) return 1;         if (compareHarp((*mharpRS_ptr), (*bharpRS_ptr))) return 1;
       }
  
         return 0;         return 0;
  
Line 599  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
Line 657  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
         mInfo.proj = (enum projection) cyleqa;          // projection method         mInfo.proj = (enum projection) cyleqa;          // projection method
         mInfo.xscale = XSCALE;         mInfo.xscale = XSCALE;
         mInfo.yscale = YSCALE;         mInfo.yscale = YSCALE;
         mInfo.nbin = NBIN;  
     int ncol0, nrow0;             // oversampled map size
  
         // Get ephemeris         // Get ephemeris
  
Line 615  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
Line 674  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
                 return 1;                 return 1;
         }         }
  
           // ========================================
           // Do this for all bitmaps, Aug 12 2013 XS
           // ========================================
   
       mInfo.nbin = 1;                     // for bitmaps. suppress anti-aliasing
           ncol0 = mInfo.ncol;
           nrow0 = mInfo.nrow;
   
           mInfo.xi_out = (float *) (malloc(ncol0 * nrow0 * sizeof(float)));
           mInfo.zeta_out = (float *) (malloc(ncol0 * nrow0 * sizeof(float)));
   
           findCoord(&mInfo);              // compute it here so it could be shared by the following 4 functions
   
           if (mapScaler(sharpRec, mharpRec, mharpRec, &mInfo, "bitmap")) {
                   SHOW("CEA: mapping bitmap error\n");
                   return 1;
           }
           printf("Bitmap mapping done.\n");
   
       if (mapScaler(sharpRec, bharpRec, mharpRec, &mInfo, "conf_disambig")) {
                   SHOW("CEA: mapping conf_disambig error\n");
                   return 1;
           }
           printf("Conf disambig mapping done.\n");
   
       free(mInfo.xi_out);
           free(mInfo.zeta_out);
   
           // ========================================
           // Do this again for floats, Aug 12 2013 XS
           // ========================================
         // Create xi_out, zeta_out array in mInfo:         // Create xi_out, zeta_out array in mInfo:
         // Coordinates to sample in original full disk image         // Coordinates to sample in original full disk image
  
         int ncol0, nrow0;               // oversampled map size          mInfo.nbin = NBIN;
         ncol0 = mInfo.ncol * mInfo.nbin + (mInfo.nbin / 2) * 2; // pad with nbin/2 on edge to avoid NAN         ncol0 = mInfo.ncol * mInfo.nbin + (mInfo.nbin / 2) * 2; // pad with nbin/2 on edge to avoid NAN
         nrow0 = mInfo.nrow * mInfo.nbin + (mInfo.nbin / 2) * 2;         nrow0 = mInfo.nrow * mInfo.nbin + (mInfo.nbin / 2) * 2;
  
Line 633  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
Line 723  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
                 SHOW("CEA: mapping magnetogram error\n");                 SHOW("CEA: mapping magnetogram error\n");
                 return 1;                 return 1;
         }         }
         if (mapScaler(sharpRec, mharpRec, mharpRec, &mInfo, "bitmap")) {  
                 SHOW("CEA: mapping bitmap error\n");  
                 return 1;  
         }  
         printf("Magnetogram mapping done.\n");         printf("Magnetogram mapping done.\n");
   
         if (mapScaler(sharpRec, dopRec, mharpRec, &mInfo, "Dopplergram")) {         if (mapScaler(sharpRec, dopRec, mharpRec, &mInfo, "Dopplergram")) {
                 SHOW("CEA: mapping dopplergram error\n");                 SHOW("CEA: mapping dopplergram error\n");
                 return 1;                 return 1;
Line 650  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
Line 737  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
         }         }
         printf("Intensitygram mapping done.\n");         printf("Intensitygram mapping done.\n");
  
         if (mapScaler(sharpRec, bharpRec, mharpRec, &mInfo, "conf_disambig")) {  
                 SHOW("CEA: mapping conf_disambig error\n");  
                 return 1;  
         }  
         printf("Conf disambig mapping done.\n");  
   
         // Mapping vector B         // Mapping vector B
  
         if (mapVectorB(sharpRec, bharpRec, &mInfo)) {         if (mapVectorB(sharpRec, bharpRec, &mInfo)) {
Line 677  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
Line 758  int createCeaRecord(DRMS_Record_t *mharp
         drms_copykey(sharpRec, mharpRec, "T_REC");         drms_copykey(sharpRec, mharpRec, "T_REC");
         drms_copykey(sharpRec, mharpRec, "HARPNUM");         drms_copykey(sharpRec, mharpRec, "HARPNUM");
  
         DRMS_Link_t *mHarpLink = hcon_lookup_lower(&sharpRec->links, "MHARP");      if (fullDisk) {
         if (mHarpLink) drms_link_set("MHARP", sharpRec, mharpRec);          DRMS_Link_t *bLink = hcon_lookup_lower(&sharpRec->links, "B");
           if (bLink) drms_link_set("B", sharpRec, bharpRec);
       } else {
         DRMS_Link_t *bHarpLink = hcon_lookup_lower(&sharpRec->links, "BHARP");         DRMS_Link_t *bHarpLink = hcon_lookup_lower(&sharpRec->links, "BHARP");
         if (bHarpLink) drms_link_set("BHARP", sharpRec, bharpRec);         if (bHarpLink) drms_link_set("BHARP", sharpRec, bharpRec);
       }
           DRMS_Link_t *mHarpLink = hcon_lookup_lower(&sharpRec->links, "MHARP");
           if (mHarpLink) drms_link_set("MHARP", sharpRec, mharpRec);
  
          setKeys(sharpRec, bharpRec, &mInfo);            // Set all other keywords      setKeys(sharpRec, mharpRec, bharpRec, &mInfo);            // Set all other keywords
         drms_copykey(sharpRec, mharpRec, "QUALITY");            // copied from los records         drms_copykey(sharpRec, mharpRec, "QUALITY");            // copied from los records
  
         // Space weather         // Space weather
Line 724  int mapScaler(DRMS_Record_t *sharpRec, D
Line 810  int mapScaler(DRMS_Record_t *sharpRec, D
         int status = 0;         int status = 0;
         int nx = mInfo->ncol, ny = mInfo->nrow, nxny = nx * ny;         int nx = mInfo->ncol, ny = mInfo->nrow, nxny = nx * ny;
         int dims[2] = {nx, ny};         int dims[2] = {nx, ny};
           int interpOpt = INTERP;         // Aug 12 XS, default, overridden below for bitmaps and conf_disambig
  
         // Input full disk array         // Input full disk array
  
Line 735  int mapScaler(DRMS_Record_t *sharpRec, D
Line 822  int mapScaler(DRMS_Record_t *sharpRec, D
         inArray = drms_segment_read(inSeg, DRMS_TYPE_FLOAT, &status);         inArray = drms_segment_read(inSeg, DRMS_TYPE_FLOAT, &status);
         if (!inArray) return 1;         if (!inArray) return 1;
  
       if (!strcmp(segName, "conf_disambig") || !strcmp(segName, "bitmap")) {
           // Moved out so it works for FD conf_disambig as well
           // Jan 2 2014 XS
           interpOpt = 3;          // Aug 12 XS, near neighbor
       }
   
         float *inData;         float *inData;
         int xsz = inArray->axis[0], ysz = inArray->axis[1];         int xsz = inArray->axis[0], ysz = inArray->axis[1];
         if ((xsz != FOURK) || (ysz != FOURK)) {         // for bitmap, make tmp full disk         if ((xsz != FOURK) || (ysz != FOURK)) {         // for bitmap, make tmp full disk
Line 757  int mapScaler(DRMS_Record_t *sharpRec, D
Line 850  int mapScaler(DRMS_Record_t *sharpRec, D
         // Mapping         // Mapping
  
         float *map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));         float *map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));
         if (performSampling(map, inData, mInfo))          if (performSampling(map, inData, mInfo, interpOpt))             // Add interpOpt for different types, Aug 12 XS
         {if (inArray) drms_free_array(inArray); free(map); return 1;}         {if (inArray) drms_free_array(inArray); free(map); return 1;}
  
         // Write out         // Write out
Line 820  int mapVectorB(DRMS_Record_t *sharpRec,
Line 913  int mapVectorB(DRMS_Record_t *sharpRec,
         float *bx_map = NULL, *by_map = NULL, *bz_map = NULL;   // intermediate maps, in CCD bxyz representation         float *bx_map = NULL, *by_map = NULL, *bz_map = NULL;   // intermediate maps, in CCD bxyz representation
  
         bx_map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));         bx_map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));
         if (performSampling(bx_map, bx_img, mInfo))          if (performSampling(bx_map, bx_img, mInfo, INTERP))
         {free(bx_img); free(by_img); free(bz_img); free(bx_map); return 1;}         {free(bx_img); free(by_img); free(bz_img); free(bx_map); return 1;}
  
         by_map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));         by_map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));
         if (performSampling(by_map, by_img, mInfo))          if (performSampling(by_map, by_img, mInfo, INTERP))
         {free(bx_img); free(by_img); free(bz_img); free(bz_map); return 1;}         {free(bx_img); free(by_img); free(bz_img); free(bz_map); return 1;}
  
         bz_map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));         bz_map = (float *) (malloc(nxny * sizeof(float)));
         if (performSampling(bz_map, bz_img, mInfo))          if (performSampling(bz_map, bz_img, mInfo, INTERP))
         {free(bx_img); free(by_img); free(bz_img); free(bz_map); return 1;}         {free(bx_img); free(by_img); free(bz_img); free(bz_map); return 1;}
  
         free(bx_img); free(by_img); free(bz_img);         free(bx_img); free(by_img); free(bz_img);
Line 1107  void findCoord(struct mapInfo *mInfo)
Line 1200  void findCoord(struct mapInfo *mInfo)
  *  *
  */  */
  
 int performSampling(float *outData, float *inData, struct mapInfo *mInfo)  int performSampling(float *outData, float *inData, struct mapInfo *mInfo, int interpOpt)
 { {
  
         int status = 0;         int status = 0;
           int ind_map;
  
         int ncol0 = mInfo->ncol * mInfo->nbin + (mInfo->nbin / 2) * 2;  // pad with nbin/2 on edge to avoid NAN         int ncol0 = mInfo->ncol * mInfo->nbin + (mInfo->nbin / 2) * 2;  // pad with nbin/2 on edge to avoid NAN
         int nrow0 = mInfo->nrow * mInfo->nbin + (mInfo->nbin / 2) * 2;         int nrow0 = mInfo->nrow * mInfo->nbin + (mInfo->nbin / 2) * 2;
  
         float *outData0 = (float *) (malloc(ncol0 * nrow0 * sizeof(float)));          // Changed Aug 12 2013, XS, for bitmaps
           float *outData0;
           if (interpOpt == 3 && mInfo->nbin == 1) {
             outData0 = outData;
           } else {
             outData0 = (float *) (malloc(ncol0 * nrow0 * sizeof(float)));
           }
  
         float *xi_out = mInfo->xi_out;         float *xi_out = mInfo->xi_out;
         float *zeta_out = mInfo->zeta_out;         float *zeta_out = mInfo->zeta_out;
Line 1123  int performSampling(float *outData, floa
Line 1223  int performSampling(float *outData, floa
         // Interpolation         // Interpolation
  
         struct fint_struct pars;         struct fint_struct pars;
         int interpOpt = INTERP;         // Use Wiener by default, 6 order, 1 constraint          // Aug 12 2013, passed in as argument now
  
         switch (interpOpt) {         switch (interpOpt) {
                 case 0:                 // Wiener, 6 order, 1 constraint                 case 0:                 // Wiener, 6 order, 1 constraint
Line 1135  int performSampling(float *outData, floa
Line 1235  int performSampling(float *outData, floa
                 case 2:                 // Bilinear                 case 2:                 // Bilinear
                         init_finterpolate_linear(&pars, 1.);                         init_finterpolate_linear(&pars, 1.);
                         break;                         break;
                   case 3:                 // Near neighbor
                     break;
                 default:                 default:
                         return 1;                         return 1;
         }         }
  
           printf("interpOpt = %d, nbin = %d ", interpOpt, mInfo->nbin);
           if (interpOpt == 3) {                   // Aug 6 2013, Xudong
                   for (int row0 = 0; row0 < nrow0; row0++) {
                                   for (int col0 = 0; col0 < ncol0; col0++) {
                                           ind_map = row0 * ncol0 + col0;
                                           outData0[ind_map] = nnb(inData, FOURK, FOURK, xi_out[ind_map], zeta_out[ind_map]);
                                   }
                           }
           } else {
         finterpolate(&pars, inData, xi_out, zeta_out, outData0,         finterpolate(&pars, inData, xi_out, zeta_out, outData0,
                                  FOURK, FOURK, FOURK, ncol0, nrow0, ncol0, DRMS_MISSING_FLOAT);                                  FOURK, FOURK, FOURK, ncol0, nrow0, ncol0, DRMS_MISSING_FLOAT);
           }
  
         // Rebinning, smoothing         // Rebinning, smoothing
  
           if (interpOpt == 3 && mInfo->nbin == 1) {
             return 0;
           } else {
         frebin(outData0, outData, ncol0, nrow0, mInfo->nbin, 1);                // Gaussian         frebin(outData0, outData, ncol0, nrow0, mInfo->nbin, 1);                // Gaussian
         free(outData0);         // Dec 18 2012         free(outData0);         // Dec 18 2012
           }
  
         //         //
  
Line 1384  int readVectorB(DRMS_Record_t *inRec, fl
Line 1500  int readVectorB(DRMS_Record_t *inRec, fl
         int llx, lly;           // lower-left corner         int llx, lly;           // lower-left corner
         int bmx, bmy;           // bitmap size         int bmx, bmy;           // bitmap size
  
       if (fullDisk) {
           llx = lly = 0;
           bmx = bmy = FOURK;
       } else {
         llx = (int)(drms_getkey_float(inRec, "CRPIX1", &status)) - 1;         llx = (int)(drms_getkey_float(inRec, "CRPIX1", &status)) - 1;
         lly = (int)(drms_getkey_float(inRec, "CRPIX2", &status)) - 1;         lly = (int)(drms_getkey_float(inRec, "CRPIX2", &status)) - 1;
   
         bmx = inArray_ambig->axis[0];         bmx = inArray_ambig->axis[0];
         bmy = inArray_ambig->axis[1];         bmy = inArray_ambig->axis[1];
       }
  
         int kx, ky, kOff;         int kx, ky, kOff;
         int ix = 0, jy = 0, yOff = 0, iData = 0;         int ix = 0, jy = 0, yOff = 0, iData = 0;
         int xDim = FOURK, yDim = FOURK;         int xDim = FOURK, yDim = FOURK;
           int amb = 0;
  
         for (jy = 0; jy < yDim; jy++)         for (jy = 0; jy < yDim; jy++)
         {         {
Line 1415  int readVectorB(DRMS_Record_t *inRec, fl
Line 1536  int readVectorB(DRMS_Record_t *inRec, fl
                                 continue;                                 continue;
                         } else {                         } else {
                                 kOff = ky * bmx + kx;                                 kOff = ky * bmx + kx;
                                 if (ambig[kOff] % 2) {          // 180  //                              if (ambig[kOff] % 2) {          // 180
                                   // Feb 12 2014, use bit #2 for full disk, lowest bit for patch
                                   if (fullDisk) { amb = (ambig[kOff] / 4) % 2; } else { amb = ambig[kOff] % 2; }
                                   if (amb) {                              // Feb 12 2014, use bit #2
                                         bx_img[iData] *= -1.; by_img[iData] *= -1.;                                         bx_img[iData] *= -1.; by_img[iData] *= -1.;
                                 }                                 }
                         }                         }
Line 1455  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
Line 1579  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
         DRMS_Array_t *inArrays[9];         DRMS_Array_t *inArrays[9];
  
         // Read full disk images         // Read full disk images
     // Do we need disambig? Dec 30 XS
  
         for (int iSeg = 0; iSeg < 9; iSeg++) {         for (int iSeg = 0; iSeg < 9; iSeg++) {
  
Line 1468  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
Line 1593  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
         float *errbT0 = data_ptr[3], *errbI0 = data_ptr[4], *errbA0 = data_ptr[5];         float *errbT0 = data_ptr[3], *errbI0 = data_ptr[4], *errbA0 = data_ptr[5];
         float *errbTbI0 = data_ptr[6], *errbTbA0 = data_ptr[7], *errbIbA0 = data_ptr[8];         float *errbTbI0 = data_ptr[6], *errbTbA0 = data_ptr[7], *errbIbA0 = data_ptr[8];
  
           // Add disambig, Feb 12 2014
   
           DRMS_Segment_t *inSeg = drms_segment_lookup(inRec, "disambig");
           DRMS_Array_t *inArray_ambig = drms_segment_read(inSeg, DRMS_TYPE_CHAR, &status);
           if (status) return 1;
           char *ambig = (char *)inArray_ambig->data;
   
           int llx, lly;           // lower-left corner
           int bmx, bmy;           // bitmap size
   
     if (fullDisk) {
       llx = lly = 0;
       bmx = bmy = FOURK;
     } else {
       llx = (int)(drms_getkey_float(inRec, "CRPIX1", &status)) - 1;
       lly = (int)(drms_getkey_float(inRec, "CRPIX2", &status)) - 1;
       bmx = inArray_ambig->axis[0];
       bmy = inArray_ambig->axis[1];
     }
   
     int idx, idx_a;
     int amb;
   
     for (int j = 0; j < bmy; j++) {
           for (int i = 0; i < bmx; i++) {
                   idx_a = j * bmx + i;
                   idx = (j + lly) * FOURK + (i + llx);
                   // Feb 12 2014, use bit #2 for full disk, lowest bit for patch
                   if (fullDisk) { amb = (ambig[idx_a] / 4) % 2; } else { amb = ambig[idx_a] % 2; }
                   if (amb) { bA0[idx] += 180.; }
           }
     }
   
         // Convert errors to variances, correlation coefficients to covariances         // Convert errors to variances, correlation coefficients to covariances
  
         for (int i = 0; i < FOURK2; i++) {         for (int i = 0; i < FOURK2; i++) {
Line 1476  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
Line 1634  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
                 if (fabs(errbA0[i]) > 180.) errbA0[i] = 180.;                 if (fabs(errbA0[i]) > 180.) errbA0[i] = 180.;
  
                 bT[i] = bT0[i];                 bT[i] = bT0[i];
                 bI[i] = bI0[i];                  bI[i] = bI0[i];         // in deg, coverted in errorprop
                 bA[i] = bA0[i];                 bA[i] = bA0[i];
  
                 errbT[i] = errbT0[i] * errbT0[i];                 errbT[i] = errbT0[i] * errbT0[i];
Line 1492  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
Line 1650  int readVectorBErr(DRMS_Record_t *inRec,
         //         //
  
         for (int iSeg = 0; iSeg < 9; iSeg++) drms_free_array(inArrays[iSeg]);         for (int iSeg = 0; iSeg < 9; iSeg++) drms_free_array(inArrays[iSeg]);
           drms_free_array(inArray_ambig);         // Feb 12 2014
  
         return 0;         return 0;
  
Line 1567  int createCutRecord(DRMS_Record_t *mharp
Line 1726  int createCutRecord(DRMS_Record_t *mharp
         if (bHarpLink) drms_link_set("BHARP", sharpRec, bharpRec);         if (bHarpLink) drms_link_set("BHARP", sharpRec, bharpRec);
  
         setSWIndex(sharpRec, swKeys_ptr);       // Set space weather indices         setSWIndex(sharpRec, swKeys_ptr);       // Set space weather indices
         setKeys(sharpRec, bharpRec, NULL);              // Set all other keywords, NULL specifies cutout          setKeys(sharpRec, mharpRec, bharpRec, NULL);              // Set all other keywords, NULL specifies cutout
  
         // Stats         // Stats
  
Line 1624  int writeCutout(DRMS_Record_t *outRec, D
Line 1783  int writeCutout(DRMS_Record_t *outRec, D
                 return 1;                 return 1;
         }         }
  
           // Feb 12 2014, fool-proof, for patch, change everything to 0 or 7!!!
           // This is a fix for disambiguation before Aug 2013
   
           if (!strcmp(SegName, "disambig") && !fullDisk) {
                   double *disamb = (double *) (cutoutArray->data);
                   for (int i = 0; i < nxny; i++) {
                           if (((int)disamb[i]) % 2) { disamb[i] = 7; } else { disamb[i] = 0; }
                   }
           }
   
         /* Adding disambiguation resolution to cutout azimuth? */         /* Adding disambiguation resolution to cutout azimuth? */
  
 #if DISAMB_AZI #if DISAMB_AZI
           int amb;
         if (!strcmp(SegName, "azimuth")) {         if (!strcmp(SegName, "azimuth")) {
                 DRMS_Segment_t *disambSeg = NULL;                 DRMS_Segment_t *disambSeg = NULL;
                 disambSeg = drms_segment_lookup(inRec, "disambig");                 disambSeg = drms_segment_lookup(inRec, "disambig");
                 if (!disambSeg) {drms_free_array(cutoutArray); return 1;}                 if (!disambSeg) {drms_free_array(cutoutArray); return 1;}
                 DRMS_Array_t *disambArray;                 DRMS_Array_t *disambArray;
           if (fullDisk) { // Jan 2 2014 XS
               disambArray = drms_segment_readslice(disambSeg, DRMS_TYPE_CHAR, ll, ur, &status);
               if (status) return 1;
           } else {
                 if (disambSeg->axis[0] == nx && disambSeg->axis[1] == ny) {                 if (disambSeg->axis[0] == nx && disambSeg->axis[1] == ny) {
                         disambArray = drms_segment_read(disambSeg, DRMS_TYPE_CHAR, &status);                         disambArray = drms_segment_read(disambSeg, DRMS_TYPE_CHAR, &status);
                         if (status) {drms_free_array(cutoutArray); return 1;}                         if (status) {drms_free_array(cutoutArray); return 1;}
Line 1639  int writeCutout(DRMS_Record_t *outRec, D
Line 1813  int writeCutout(DRMS_Record_t *outRec, D
             drms_free_array(cutoutArray);             drms_free_array(cutoutArray);
                         return 1;                         return 1;
                 }                 }
           }
                 double *azimuth = (double *) cutoutArray->data;                 double *azimuth = (double *) cutoutArray->data;
                 char *disamb = (char *) disambArray->data;                 char *disamb = (char *) disambArray->data;
                 for (int n = 0; n < nxny; n++) {                 for (int n = 0; n < nxny; n++) {
                         if (disamb[n]) azimuth[n] += 180.;  //                      if (disamb[n] % 2) azimuth[n] += 180.;      // Nov 12 2013 Fixed!!!
                           // Feb 12 2014, use bit #2 for full disk, lowest bit for patch
                           if (fullDisk) { amb = (disamb[n] / 4) % 2; } else { amb = disamb[n] % 2; }
                           if (amb) azimuth[n] += 180.;
                 }                 }
                 drms_free_array(disambArray);                 drms_free_array(disambArray);
         }         }
Line 1847  void computeSWIndex(struct swIndex *swKe
Line 2025  void computeSWIndex(struct swIndex *swKe
         swKeys_ptr->totpot_err         = DRMS_MISSING_FLOAT;         swKeys_ptr->totpot_err         = DRMS_MISSING_FLOAT;
         }         }
  
         if (computeShearAngle(bx_err, by_err, bh_err, bx, by, bz, bpx, bpy, bpz, dims,          if (computeShearAngle(bx_err, by_err, bz_err, bx, by, bz, bpx, bpy, bpz, dims,
                                                   &(swKeys_ptr->meanshear_angle), &(swKeys_ptr->meanshear_angle_err), &(swKeys_ptr->area_w_shear_gt_45),                                                   &(swKeys_ptr->meanshear_angle), &(swKeys_ptr->meanshear_angle_err), &(swKeys_ptr->area_w_shear_gt_45),
                                                   mask, bitmask)) {                                                   mask, bitmask)) {
                 swKeys_ptr->meanshear_angle    = DRMS_MISSING_FLOAT; // If fail, fill in NaN                 swKeys_ptr->meanshear_angle    = DRMS_MISSING_FLOAT; // If fail, fill in NaN
Line 1920  void setSWIndex(DRMS_Record_t *outRec, s
Line 2098  void setSWIndex(DRMS_Record_t *outRec, s
  *  *
  */  */
  
 void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS_Record_t *inRec, struct mapInfo *mInfo)  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS_Record_t *mharpRec, DRMS_Record_t *bharpRec, struct mapInfo *mInfo)
 { {
         copy_me_keys(inRec, outRec);  
         copy_patch_keys(inRec, outRec);          copy_me_keys(bharpRec, outRec);
         copy_geo_keys(inRec, outRec);          copy_patch_keys(mharpRec, outRec);      // Dec 30
         copy_ambig_keys(inRec, outRec);          copy_geo_keys(mharpRec, outRec);        // Dec 30
           copy_ambig_keys(bharpRec, outRec);
  
     int status = 0;     int status = 0;
  
         // Change a few geometry keywords for CEA records          // Change a few geometry keywords for CEA & cutout records
         if (mInfo != NULL) {          if (mInfo != NULL) {        // CEA
  
         drms_setkey_float(outRec, "CRPIX1", mInfo->ncol/2. + 0.5);         drms_setkey_float(outRec, "CRPIX1", mInfo->ncol/2. + 0.5);
                 drms_setkey_float(outRec, "CRPIX2", mInfo->nrow/2. + 0.5);                 drms_setkey_float(outRec, "CRPIX2", mInfo->nrow/2. + 0.5);
Line 1949  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS
Line 2128  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS
                 drms_setkey_string(outRec, "CTYPE2", key);                 drms_setkey_string(outRec, "CTYPE2", key);
                 drms_setkey_float(outRec, "CROTA2", 0.0);                 drms_setkey_float(outRec, "CROTA2", 0.0);
  
         } else {          // Jan 2 2014 XS
           int nSeg = ARRLENGTH(CEASegs);
           for (int iSeg = 0; iSeg < nSeg; iSeg++) {
               DRMS_Segment_t *outSeg = NULL;
               outSeg = drms_segment_lookup(outRec, CEASegs[iSeg]);
               if (!outSeg) continue;
               // Set Bunit
               char bunit_xxx[20];
               sprintf(bunit_xxx, "BUNIT_%03d", iSeg);
               //printf("%s, %s\n", bunit_xxx, CEABunits[iSeg]);
               drms_setkey_string(outRec, bunit_xxx, CEABunits[iSeg]);
           }
  
         float disk_xc = drms_getkey_float(inRec, "IMCRPIX1", &status);          } else {        // Cutout
         float disk_yc = drms_getkey_float(inRec, "IMCRPIX2", &status);  
         float x_ll = drms_getkey_float(inRec, "CRPIX1", &status);          float disk_xc, disk_yc;
         float y_ll = drms_getkey_float(inRec, "CRPIX2", &status);          if (fullDisk) {
               disk_xc = drms_getkey_float(bharpRec, "CRPIX1", &status);
               disk_yc = drms_getkey_float(bharpRec, "CRPIX2", &status);
           } else {
               disk_xc = drms_getkey_float(mharpRec, "IMCRPIX1", &status);
               disk_yc = drms_getkey_float(mharpRec, "IMCRPIX2", &status);
           }
           float x_ll = drms_getkey_float(mharpRec, "CRPIX1", &status);
           float y_ll = drms_getkey_float(mharpRec, "CRPIX2", &status);
         // Defined as disk center's pixel address wrt lower-left of cutout         // Defined as disk center's pixel address wrt lower-left of cutout
         drms_setkey_float(outRec, "CRPIX1", disk_xc - x_ll + 1.);         drms_setkey_float(outRec, "CRPIX1", disk_xc - x_ll + 1.);
                 drms_setkey_float(outRec, "CRPIX2", disk_yc - y_ll + 1.);                 drms_setkey_float(outRec, "CRPIX2", disk_yc - y_ll + 1.);
Line 1962  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS
Line 2160  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS
                 drms_setkey_float(outRec, "CRVAL1", 0);                 drms_setkey_float(outRec, "CRVAL1", 0);
                 drms_setkey_float(outRec, "CRVAL2", 0);                 drms_setkey_float(outRec, "CRVAL2", 0);
  
           // Jan 2 2014 XS
           int nSeg = ARRLENGTH(CutSegs);
           for (int iSeg = 0; iSeg < nSeg; iSeg++) {
               DRMS_Segment_t *outSeg = NULL;
               outSeg = drms_segment_lookup(outRec, CutSegs[iSeg]);
               if (!outSeg) continue;
               // Set Bunit
               char bunit_xxx[20];
               sprintf(bunit_xxx, "BUNIT_%03d", iSeg);
               //printf("%s, %s\n", bunit_xxx, CutBunits[iSeg]);
               drms_setkey_string(outRec, bunit_xxx, CutBunits[iSeg]);
           }
   
   
         }         }
  
         char timebuf[1024];         char timebuf[1024];
         float UNIX_epoch = -220924792.000; /* 1970.01.01_00:00:00_UTC */         float UNIX_epoch = -220924792.000; /* 1970.01.01_00:00:00_UTC */
         double val;         double val;
  
         val = drms_getkey_double(inRec, "DATE",&status);          val = drms_getkey_double(bharpRec, "DATE", &status);
         drms_setkey_double(outRec, "DATE_B", val);         drms_setkey_double(outRec, "DATE_B", val);
         sprint_time(timebuf, (double)time(NULL) + UNIX_epoch, "ISO", 0);         sprint_time(timebuf, (double)time(NULL) + UNIX_epoch, "ISO", 0);
         drms_setkey_string(outRec, "DATE", timebuf);         drms_setkey_string(outRec, "DATE", timebuf);
Line 1984  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS
Line 2196  void setKeys(DRMS_Record_t *outRec, DRMS
  
 }; };
  
 //  
 //  
  
 /* ############# Nearest neighbour interpolation ############### */ /* ############# Nearest neighbour interpolation ############### */
  
Line 2021  void frebin (float *image_in, float *ima
Line 2231  void frebin (float *image_in, float *ima
         fresize(&fresizes, image_in, image_out, nx, ny, nlead, nxout, nyout, nxout, xoff, yoff, DRMS_MISSING_FLOAT);         fresize(&fresizes, image_in, image_out, nx, ny, nlead, nxout, nyout, nxout, xoff, yoff, DRMS_MISSING_FLOAT);
  
 } }
   


Legend:
Removed from v.1.16  
changed lines
  Added in v.1.20

Karen Tian
Powered by
ViewCVS 0.9.4